Като научна организация Националният институт по метеорология и хидрология участва в редица научни и научно-приложни поректи.

• Научноизследователски план на НИМХ

• Работещи продукти и системи от приключили проекти;

• Приключили проекти

• Текущи проекти

• Разработване на хармонизирана система за моделиране на водния баланс за басейна на река Дунав
• Оценка на нехидростатичния числен модел RegCM при симулиране на климатичните промени на екстремните метеорологични явления
• Прогноза за замърсяване на въздуха с използване на данни от Услугата за мониторинг на атмосферата на програма Коперник на ЕС
• Национална програма „Млади учени и постдокторанти - 2“ - първи етап
• Участие на НИМХ в Националната научна програма „Интелигентно растениевъдство“
• Участие на НИМХ в Националната научна програма „Здравословни храни за силна биоикономика и качество на живот“
• MASRI - Инфраструктура за устойчиво развитие в областта на морските изследвания, обвързана и с участието на България в Европейската инфраструктура EURO-ARGO
• DAREFFORT — Подобряване сътрудничеството в областта на прогнозирането на наводнения в Басейна на река Дунав — проект на ЕС
• FLOODGUARD — Интегрирани действия за съвместна координация и реагиране на рисковете от наводнения в трансграничната зона
• LSA-SAF — Спътникови приложения за анализ на земната повърхност
• SALGEE — Спътникови приложения за анализ на земната повърхност за региона на Югоизточна и Източна Европа
• България, като член на EUMETSAT, участва в разработването на продукти от проекта H-SAF, който частично се финансира от EUMETSAT.